การท่าเรือฯ ได้ว่าจ้างบริษัท เอเชี่ยน เอ็นจิเนียริ่ง คอนซัลแต้นส์ จำกัด เป็นที่ปรึกษาเพื่อจัดทำรายงานการศึกษาความเหมาะสมทางด้านวิศวกรรมและการเงินของโครงการฯ ซึ่งคณะกรรมการการท่าเรือฯ ได้มีมติเมื่อวันที่ 30 กรกฎาคม 2552 เห็นชอบรายงานการศึกษาฯ รวมทั้งงบประมาณและรูปแบบการลงทุนของโครงการฯ  จำนวน 2,570.000 ล้านบาท  เป็นแผนการลงทุนในการดำเนินโครงการฯ จำนวน 2,025.300 ล้านบาท (ไม่รวมส่วนของการจัดหาเครื่องมือย่อยและระบบ Operation (IT) ที่ภาคเอกชนเป็นผู้ลงทุน  จำนวน 544.700 ล้านบาท)

มติคณะรัฐมนตรีให้กระทรวงคมนาคมแจ้งการท่าเรือฯ ให้ดำเนินการตามความเห็นที่สำนักงานคณะกรรมการพัฒนาการเศรษฐกิจและสังคมแห่งชาติ (สศช.) เสนอโดยให้การท่าเรือฯ ทบทวนแผนการดำเนินงานของโครงการให้มีความเหมาะสมและสอดคล้องกับแผนการดำเนินงานของการรถไฟฯ ในปัจจุบัน พร้อมทั้งเร่งศึกษาความเหมาะสมของอัตราค่าภาระในการให้บริการและรูปแบบการให้เอกชนเข้าร่วมลงทุนในโครงการตามขั้นตอนของ พ.ร.บ. ว่าด้วยการให้เอกชนเข้าร่วมงานหรือดำเนินการในกิจการของรัฐ พ.ศ. 2535 ภายใต้กรอบวงเงิน 39.000 ล้านบาท  และนำเสนอโครงการให้ สศช. พิจารณาอีกครั้งหนึ่งโดยด่วน

คณะกรรมการการท่าเรือฯ อนุมัติตั้งงบประมาณทำการประจำปีงบประมาณ 2554 รายการจ้างที่ปรึกษา จำนวนเงิน 30.000 ล้านบาท  เพื่อจัดจ้างที่ปรึกษาศึกษาข้อมูลตามความเห็นของ สศช. พร้อมทั้งออกแบบรายละเอียดสำหรับการก่อสร้างและจัดทำรายงานการศึกษาวิเคราะห์ผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมของโครงการฯ  การท่าเรือฯ ได้ลงนามในสัญญาเมื่อวันที่  21 ธันวาคม 2553 จ้างกลุ่มบริษัท เซ้าท์อี๊สท์เอเซียเทคโนโลยี จำกัด เป็นที่ปรึกษาเพื่อศึกษาวิเคราะห์โครงการและออกแบบรายละเอียดสำหรับก่อสร้างโครงการพัฒนาศูนย์การขนส่งตู้สินค้าทางรถไฟที่ท่าเรือแหลมฉบัง  ในวงเงิน 28,424,000 บาท (ไม่รวมภาษีมูลค่าเพิ่ม) ระยะเวลาดำเนินการ 180 วัน นับถัดจากวันลงนามในสัญญา ปัจจุบันอยู่ระหว่างที่ปรึกษาศึกษาวิเคราะห์โครงการและออกแบบรายละเอียดสำหรับก่อสร้างฯ